一种鉴定样本中肿瘤负荷的方法和系统

基本信息

申请号 CN201610842333.8 申请日 -
公开(公告)号 CN106367512A 公开(公告)日 2017-02-01
申请公布号 CN106367512A 申请公布日 2017-02-01
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;G06F19/22(2011.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 薄世平;梁覃斯;任军;陆思嘉 申请(专利权)人 上海序康医疗科技有限公司
代理机构 上海一平知识产权代理有限公司 代理人 上海序康医疗科技有限公司;上海亿康医学检验所有限公司
地址 201403 上海市奉贤区金齐路868号5232室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种鉴定样本中肿瘤负荷的方法和系统,具体地,本发明提供了一种非诊断性地鉴定样本中肿瘤负荷的方法,包括步骤:(i)提供一待测样本;(ii)对所述待测样本进行测序,从而获得所述样本的基因组序列;(iii)将步骤(ii)获得的基因组序列与参考基因组进行比对,从而获得基因组序列在参考基因组上的位置信息;(iv)将所述的参考基因组分成M个区域片段,其中每个区域片段为一个窗口b,计算每个窗口b的拷贝数;(v)对步骤(iv)的每个窗口b进行Z检验,从而计算每个窗口b的Z值;和(vi)根据步骤(v)所得到的Z值,计算基因组混乱度(GAS),基于基因组混乱度的数值鉴定所述待测样本中的肿瘤负荷。本发明的方法和系统可提高肿瘤检测的灵敏性和通用性。