一种转录本的分类方法

基本信息

申请号 CN201910388054.2 申请日 -
公开(公告)号 CN111916147A 公开(公告)日 2020-11-10
申请公布号 CN111916147A 申请公布日 2020-11-10
分类号 G16B20/00(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分类 物理
发明人 封力;汤冬;王毓博;李净净;梁帆;胡江;汪德鹏 申请(专利权)人 武汉希望组生物科技有限公司
代理机构 武汉河山金堂专利事务所(普通合伙) 代理人 胡清堂
地址 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区花城大道8号武汉软件新城2期C11栋19层01号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明属于生物技术信息领域,具体涉及一种转录本分类方法,该方法是通过准确定位剪切位点对转录本进行分类,具体包括以下步骤:对测序所得全长转录本结果质控,获得高质量全长转录本;将高质量全长转录本与参考基因组比对,获得相同基因模型下的所有转录本信息,去冗余,一个基因模型下的一种剪切模式只保留唯一最长的转录本;根据剪切位点,对全长转录本进行分类,获得初步分类结果;过滤初步分类结果,获得最终分类结果。该方法分类准确,假阳性率很低,适用性广泛,有效解决了现有技术不准确、分类不理想的缺陷。