一种对组装序列排序的方法及系统
基本信息
| 申请号 | CN201910270433.1 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN110020726A | 公开（公告）日 | 2019-07-16 |
| 申请公布号 | CN110020726A | 申请公布日 | 2019-07-16 |
| 分类号 | G06N3/12;G06K9/62 | 分类 | 计算；推算；计数; |
| 发明人 | 李净净;易嘉成;胡江;汪德鹏 | 申请（专利权）人 | 武汉希望组生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京集佳知识产权代理有限公司 | 代理人 | 武汉未来组生物科技有限公司 |
| 地址 | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区花城大道8号武汉软件新城2期C11栋19层01号 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种对组装序列排序的方法及系统，该方法包括：对DNA测序片段进行组装后的目标重叠群进行切分处理，获得目标数据；对目标数据进行定向和排序处理，获得若干个排列结果；计算每种排列结果的交联信号值的离散程度，并计算获得目标数据中的切分序列的挂载率，切分序列表征对重叠群按照预设切分长度进行切分后的序列；依据离散程度和挂载率，确定初始排列结果；将初始排列结果进行互作热图验证，若满足预设验证条件，则将初始排列结果确定为目标排列结果，若不满足，则对初始排列结果进行调整，获得目标排列结果。通过本发明解决了现有技术排序不准确的问题及可以实现对有明显组装错误的重叠组进行纠错。 |
