一种高通量测序数据匹配方法
基本信息
申请号 | CN201410376285.9 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN105320850A | 公开(公告)日 | 2016-02-10 |
申请公布号 | CN105320850A | 申请公布日 | 2016-02-10 |
分类号 | G06F19/22(2011.01)I | 分类 | 计算;推算;计数; |
发明人 | 张艺;何飞;马丰收;邹晓文 | 申请(专利权)人 | 晶能生物技术(上海)有限公司 |
代理机构 | - | 代理人 | - |
地址 | 201111 上海市闵行区元江路5500号第2幢1187室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明属于在分子生物学技术领域,本发明属于分子生物信息检测领域,具体涉及在已有高通量DNA测序数据匹配基础上,基于环境平台修正因子增加测序数据的匹配数量,以提高测序数据的利用率的一种高通量DNA测序数据匹配方法。本发明包括:获取测序数据;初步匹配高通量DNA测序数据得到匹配成功数据集和匹配失败数据集;设置基于实验平台和环境的匹配修正因子k;用基于修正因子k的模型对匹配失败集中数据重新匹配;提取测序数据匹配失败集中成功匹配数据。本发明在原有高通量DNA测序数据匹配映射基础上,通过评估匹配失败测序数据集中数据发生成功匹配的可能,进一步增加成功匹配映射的数据数量,以提高测序数据的利用率。 |
