一种基于宏基因组学的病原微生物检测方法及装置

基本信息

申请号 CN202111291817.5 申请日 -
公开(公告)号 CN113744807B 公开(公告)日 2022-03-11
申请公布号 CN113744807B 申请公布日 2022-03-11
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B30/20(2019.01)I 分类 物理
发明人 盖伟;李瑞琳;关尚京 申请(专利权)人 微岩医学科技(北京)有限公司
代理机构 北京集佳知识产权代理有限公司 代理人 张影
地址 100176北京市大兴区北京经济技术开发区经海四路156号院11号楼2层A区001室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于宏基因组学的病原微生物检测方法及装置,包括:获取待检测样本的宏基因组测序数据;对宏基因组测序数据进行预处理,得到目标数据;对目标数据进行筛选,得到目标序列;对目标序列进行聚类分析,获得待测样本的候选物种类别;将目标数据与非冗余参考基因集进行比对,并计算每个基因在单个样本中的丰度,得到待测样本的目标物种分类信息;将目标数据与病原微生物可检测数据库中的信息进行比对,获得待测样本的耐药基因和毒性元件信息;将目标物种分类信息、耐药基因和毒性元件信息,确定为待检测样本的检测结果。本发明提升了病原微生物检测适用性范围和病原检测准确性。