基于机器学习筛选细菌耐药表型相关重要特征基因的方法

基本信息

申请号 CN202111400540.5 申请日 -
公开(公告)号 CN114067912A 公开(公告)日 2022-02-18
申请公布号 CN114067912A 申请公布日 2022-02-18
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B30/20(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;G16H70/40(2018.01)I;G06N20/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 韩朋;饶冠华;高建鹏;陈方媛;蒋智 申请(专利权)人 天津金匙医学科技有限公司
代理机构 北京知汇林知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 董涛
地址 301799天津市武清区武清开发区福源道北侧创业总部基地B21号楼901室
法律状态 -

摘要

摘要 本申请涉及一种基于机器学习技术筛选细菌耐药表型相关重要特征基因的方法,该方法针对细菌抗生素耐药表型,基于BGWAS思想搜集公共平台上目标细菌基因组或者现行收集测序组装后得到的大样本量菌株基因组数据及其对应的抗生素药物药敏测试结果,使用机器学习方法进行基因型与耐药表型两者间关联分析,以筛选出与耐药表型相关的重要特征基因(非核心耐药基因),同时得到重要特征基因的权重系数,最后使用ROC分析确定各药物相关耐药基因可靠性。