测序深度的矫正方法及装置专利查询专利号|摘要-满商公司网

测序深度的矫正方法及装置

基本信息

申请号	CN201811616167.5	申请日	-
公开（公告）号	CN109767813B	公开（公告）日	2021-06-22
申请公布号	CN109767813B	申请公布日	2021-06-22
分类号	G16B30/00	分类	物理
发明人	柴景超;张静波;伍启熹;王建伟;刘倩;刘珂弟;唐宇	申请（专利权）人	北京优迅医学检验实验室有限公司
代理机构	北京康信知识产权代理有限责任公司	代理人	江舟;王晓婷
地址	100195 北京市海淀区四季青杏石口路65号益园C区C7
法律状态	-

摘要

本发明提供了一种测序深度的矫正方法及装置，其中，上述装置包括：获取模块，用于获取基因组上每个位点的GC含量，以及基因组的所有位点的测序深度；划分模块，用于根据每个位点的GC含量将所有位点按照指定规则分成N个不同区间，其中，N为正整数；第一处理模块，用于针对每个区间内的每个位点的测序深度Dij进行转换处理，得到第一值；确定N个区间的平均测序深度的泊松分布，并对泊松分布的值进行与测序深度Dij同样的转换处理，得到第二值；第二处理模块，用于针对每个区间，分别确定第一值的均值mi1以及第二值的均值mi2；根据第一值，mi1和mi2确定第三值；确定模块，用于对第三值进行转换处理对应的反转换处理，得到矫正后的每个位点的测序深度。