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测序深度的矫正方法及装置

基本信息

申请号 CN201811614819.1 申请日 -
公开（公告）号 CN109727638B 公开（公告）日 2021-08-17
申请公布号 CN109727638B 申请公布日 2021-08-17
分类号 G16B20/30 分类 物理
发明人 张静波;柴景超;伍启熹;王建伟;刘倩;刘珂弟;唐宇 申请（专利权）人 北京优迅医学检验实验室有限公司
代理机构 北京康信知识产权代理有限责任公司 代理人 江舟;王晓婷
地址 100195 北京市海淀区四季青杏石口路65号益园C区C7
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种测序深度的矫正方法及装置，其中，上述装置包括：获取模块，用于获取基因组上每个位点的GC含量，以及所述基因组的所有位点的测序深度；划分模块，用于根据每个位点的GC含量将所述所有位点按照指定规则分成N个不同区间，其中，N为正整数；确定模块，用于确定每个区间内位点的区间平均深度的第一泊松分布律，以及N个区间的平均测序深度的第二泊松分布律；还用于根据所述第一泊松分布律和所述第二泊松分布律确定所述每个区间内不同测序深度的权重；处理模块，用于针对所述基因组的每个位点，分别将测序深度与每个测序深度对应的权重相乘，得到矫正后的每个位点的测序深度。