一种对特征丰度数据和样本表型数据进行关联分析的方法
基本信息
| 申请号 | CN202110388456.X | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN112965971A | 公开（公告）日 | 2021-06-15 |
| 申请公布号 | CN112965971A | 申请公布日 | 2021-06-15 |
| 分类号 | G06F16/215（2019.01）I;G06F16/28（2019.01）I;G16C20/70（2019.01）I | 分类 | 计算；推算；计数; |
| 发明人 | 马玉昆;张晓伟;王帅;白晓刚;李峰峰;孙琼琳;李伟华 | 申请（专利权）人 | 北京果壳生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京纪凯知识产权代理有限公司 | 代理人 | 冀志华 |
| 地址 | 102206北京市昌平区中关村生命科学园生命园路8号院6号楼8层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及一种对特征丰度数据和样本表型数据进行关联分析的方法，其特征在于，包括如下步骤：（1）获取特征丰度数据矩阵和样本表型数据矩阵，并同时对这两个数据矩阵进行预处理；（2）对预处理后的特征丰度数据矩阵和样本表型数据矩阵进行LASSO回归，过滤掉回归过程中，回归系数被LASSO回归模型压缩为0的特征和样本；（3）计算剩余特征丰度数据矩阵中特征之间以及样本表型数据矩阵中样本之间的相关系数，并将相关性未达到预设阈值的特征和样本进行过滤；（4）对最终剩余的特征丰度数据矩阵与样本表型数据矩阵进行线性回归分析，最终得到特征丰度数据矩阵中和样本表型数据有关联的特征。本发明可以广泛应用于生物学数据分析领域。 |
