一种利用纳米孔测序的转录组分析方法
基本信息
| 申请号 | CN202010226519.7 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN111292806A | 公开（公告）日 | 2020-06-16 |
| 申请公布号 | CN111292806A | 申请公布日 | 2020-06-16 |
| 分类号 | G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I | 分类 | - |
| 发明人 | 袁晓辉;刘海平;肖世俊 | 申请（专利权）人 | 武汉古奥基因科技有限公司 |
| 代理机构 | 沈阳东大知识产权代理有限公司 | 代理人 | 武汉古奥基因科技有限公司 |
| 地址 | 430070湖北省武汉市洪山区珞狮路122号武汉理工大学孵化楼B座15楼 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 一种利用纳米孔测序的转录组分析方法，所属分子生物学技术领域，本发明公开了一种利用nanopore测序数据的转录组分析方法，包括基于minimap2快速比对获得序列之间的关系；计算序列之间比对的相似性、覆盖度、最大缺失、最大插入；利用CARNAC‑LR软件进行网络状聚类，获得序列网络状关系；将聚类得到的cluster经过pbccs软件纠错而获得CCS序列；本发明方法通过获得高质量的CCS序列之后，可以进行转录组后续的基因定量等分析。 |
