一种检测分析幽门螺旋杆菌的毒性及致病性的方法
基本信息
| 申请号 | CN201810970602.8 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN109182564B | 公开（公告）日 | 2021-05-25 |
| 申请公布号 | CN109182564B | 申请公布日 | 2021-05-25 |
| 分类号 | C12R1/01(2006.01)N;C12Q1/04(2006.01)I;C12Q1/689(2018.01)I | 分类 | - |
| 发明人 | 郜恒骏;华友佳;陈傲君 | 申请（专利权）人 | 上海芯超生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 上海市汇业律师事务所 | 代理人 | 王函 |
| 地址 | 201203 上海市浦东新区李冰路151号5号楼4楼 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开一种检测分析幽门螺旋杆菌的毒性及致病性的方法，包括：对幽门螺旋杆菌目标菌株进行DNA提取和全基因组序列检测，根据全基因组序列检测的结果进行全基因组测序数据数据分析和致病相关基因特异性分析；1)对所述致病相关基因进行分型分类；2)根据全基因组序列检测的结果统计致病相关基因的reads数；3)将重要分型基因分别统计比对到各自参考序列的百分比；4)对重要分型基因进行分型判定，对其他致病相关基因进行功能完整度判定；5)根据上述判定结果，对重要分型基因和其他致病相关基因判断其毒性、功能完整性及功能意义解读。本发明对深入理解Hp致病机制及指导Hp感染患者个性化治疗，对临床研究和教学都有非常重大的意义。 |
