一种适用于Sequel测序的三代全长转录组测序结果分析方法
基本信息
申请号 | CN202010823703.X | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN112086128A | 公开(公告)日 | 2020-12-15 |
申请公布号 | CN112086128A | 申请公布日 | 2020-12-15 |
分类号 | G16B20/30(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 沈立;姜丽荣;孙子奎 | 申请(专利权)人 | 南京派森诺基因科技有限公司 |
代理机构 | 上海天翔知识产权代理有限公司 | 代理人 | 南京派森诺基因科技有限公司 |
地址 | 211800江苏省南京市江北新区浦滨路211号扬子科创中心A栋24层2401室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种适用于Sequel测序平台的三代全长转录组分析方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一,测序数据过滤步骤;步骤二,测序数据比对步骤;步骤三,转录本注释步骤;步骤四,ORF预测步骤;步骤五,转录本功能注释步骤;步骤六,融合基因分析步骤;步骤七,LncRNA预测步骤;步骤八,可变剪切分析步骤;步骤九,可变多聚腺苷酸化分析步骤。本发明的运行速度更快,且与常用的matchannot软件相比对转录本的注释更加精细,更加便于分析转录本的类型。 |
