一种适用于Sequel测序的三代全长转录组测序结果分析方法

基本信息

申请号 CN202010823703.X 申请日 -
公开(公告)号 CN112086128A 公开(公告)日 2020-12-15
申请公布号 CN112086128A 申请公布日 2020-12-15
分类号 G16B20/30(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 沈立;姜丽荣;孙子奎 申请(专利权)人 南京派森诺基因科技有限公司
代理机构 上海天翔知识产权代理有限公司 代理人 南京派森诺基因科技有限公司
地址 211800江苏省南京市江北新区浦滨路211号扬子科创中心A栋24层2401室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种适用于Sequel测序平台的三代全长转录组分析方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一,测序数据过滤步骤;步骤二,测序数据比对步骤;步骤三,转录本注释步骤;步骤四,ORF预测步骤;步骤五,转录本功能注释步骤;步骤六,融合基因分析步骤;步骤七,LncRNA预测步骤;步骤八,可变剪切分析步骤;步骤九,可变多聚腺苷酸化分析步骤。本发明的运行速度更快,且与常用的matchannot软件相比对转录本的注释更加精细,更加便于分析转录本的类型。