一种基于无参考基因组的群体进化分析方法
基本信息
| 申请号 | CN202010768331.5 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN112164424A | 公开（公告）日 | 2021-01-01 |
| 申请公布号 | CN112164424A | 申请公布日 | 2021-01-01 |
| 分类号 | G16B40/00(2019.01)I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 刘书云;张海焕;姜丽荣;孙子奎 | 申请（专利权）人 | 南京派森诺基因科技有限公司 |
| 代理机构 | 上海天翔知识产权代理有限公司 | 代理人 | 南京派森诺基因科技有限公司 |
| 地址 | 211800江苏省南京市江北新区浦滨路211号扬子科创中心A栋24层2401室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种基于2d‑RAD测序后无参考基因组的群体进化分析方法，通过将样本进行数据拆分后过滤聚类得到群体SNP，并基于样本分组和群体SNP信息进行群体遗传参数分析后构建系统发育树，确定最佳K值后利用所述R自写脚本，根据群体SNP信息和指定的群体信息来寻找两大Group之间的共有和特有SNP信息进行无参考基因组的群体进化分析。本发明的整个数据分析比较自动化，节省了人力成本，提高了分析效率，避免了可能的人为失误且分析的数据图表更加美观。 |
