一种泛素化降解目标蛋白质的预测方法
基本信息
| 申请号 | CN201910125728.X | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN109785902A | 公开（公告）日 | 2019-05-21 |
| 申请公布号 | CN109785902A | 申请公布日 | 2019-05-21 |
| 分类号 | G16B20/00（2019.01）I; G06N3/04（2006.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 蔡鑫; 胡伟; 王力强 | 申请（专利权）人 | 成都分迪科技有限公司 |
| 代理机构 | - | 代理人 | - |
| 地址 | 610041 四川省成都市成都高新区九兴大道6号B栋515 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及一种泛素化降解目标蛋白质的预测方法，包括以步骤：A1、采用卷积神经网络方法预测蛋白亚基的相互作用；A2、构建泛素标记体系空间三维结构；A3、预测泛素化降解的目标蛋白质，先下载目标蛋白三维结构文件，使用同源建模的方法补全目标蛋白三维结构，利用上述的卷积神经网络方法预测目标蛋白与E3泛素标记体系的相互作用；然后，采用分子动力学方法优化E3泛素标记体系与目标蛋白相互作用的整体空间三维结构，根据体系的稳定性判断目标蛋白是否可能被该E3泛素标记体系标记，并通过泛素‑蛋白酶体降解。 |
