病原微生物耐药基因归属模型及其建立方法和应用

基本信息

申请号 CN202110055195.X 申请日 -
公开(公告)号 CN112863601A 公开(公告)日 2021-05-28
申请公布号 CN112863601A 申请公布日 2021-05-28
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B5/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 许腾;何福生;张俊杰;曾伟奇;张泽武;苟雪静;李永军;王小锐;苏杭 申请(专利权)人 深圳微远医疗科技有限公司
代理机构 广州新诺专利商标事务所有限公司 代理人 李海恬
地址 510130广东省广州市高新技术产业开发区科丰路31号自编三栋华南新材料创新园G10栋303号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及一种病原微生物耐药基因归属模型及其建立方法和应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:建立病原微生物基因数据库和耐药基因数据库;获取临床样本的病原微生物宏基因组测序数据,得到每个临床样本中病原微生物和所对应的耐药基因序列数据;对上述病原微生物的序列数据和耐药基因序列数据进行聚类分析,获得单个耐药基因与至少一个疑似来源病原微生物的正态分布模型,选取其中病原微生物丰度高且耐药基因序列数与病原微生物序列数强相关的模型,即得。采用该方法得到的病原微生物耐药基因归属模型,能够判断每种耐药基因究竟来源于哪种细菌,弥补了现有技术的缺陷,且具有适用范围广、准确性高的优点。