基于质谱分析的肽谱存留时间预测方法及系统

基本信息

申请号 CN202111076063.1 申请日 -
公开(公告)号 CN113936742A 公开(公告)日 2022-01-14
申请公布号 CN113936742A 申请公布日 2022-01-14
分类号 G16B40/10(2019.01)I;G16B20/00(2019.01)I;G06N3/04(2006.01)I;G01N27/62(2021.01)I 分类 物理
发明人 阮宏强;张鹏;刘泰驿 申请(专利权)人 上海中科新生命生物科技有限公司
代理机构 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 肖平安
地址 201109上海市闵行区园美路58号1幢15楼
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种基于质谱分析的肽谱存留时间预测方法及系统,包括:将谱图库中的肽段序列及肽段序列对应的保留时间转换为(肽段序列,保留时间)格式;将肽段序列按照氨基酸序列表进行转换得到肽段序列矩阵;构建双向循环神经网络模型:其中循环神经网络单细胞结构保存肽段序列矩阵及其对应的保留时间;遗忘门确认肽段序列矩阵是否保留;输入门根据遗忘门确认的结果更新肽段序列矩阵对应的保留时间;输出门输出更新后的肽段序列矩阵及对应的保留时间。通过对修饰成分进行编码,使得修饰成分对肽段序列存留时间的影响被考虑;同时通过双向循环神经网络模型,使得对肽段序列的存留时间的预测分析结果可靠。解决了如何准确预测肽谱的存留时间的问题。