预测/验证多酚类化合物激活剂对Sirtuin与烟酰胺腺嘌呤结合效果影响的方法

基本信息

申请号 CN202110006987.8 申请日 -
公开(公告)号 CN112669900A 公开(公告)日 2021-04-16
申请公布号 CN112669900A 申请公布日 2021-04-16
分类号 G16B15/00;G16C20/20 分类 物理
发明人 黄易寒;李骏;汤小苏 申请(专利权)人 杭州诺莘科技有限责任公司
代理机构 杭州天勤知识产权代理有限公司 代理人 胡红娟
地址 311400 浙江省杭州市富阳区银湖街道高尔夫路83号第六幢三楼305室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种预测/验证多酚类化合物激活剂对Sirtuin与烟酰胺腺嘌呤(NAD+)结合效果影响的方法,利用一系列对复合体系的计算处理和副本交换分子动力学模拟,Sirtuin/NAD+复合物结构和Sirtuin/激活剂/NAD+复合物结构可实现全局优化并得到稳态构型。在此基础上对两种复合物体系进行结构稳定性比较、残基稳定性比较和NAD+与Sirtuin的结合能比较,预测/验证激活剂对NAD+与Sirtuin结合效果的影响。相比实验方法,本方法时间和人力成本更低,可帮助实验进行预筛选。相比传统计算方法,本方法提供了更准确的蛋白质单/双分子稳态构型,从而使稳定性和结合能的判断更准确,整体提高了激活剂预测/验证的正确率,提升效率。