预测/验证多酚类化合物激活剂对Sirtuin与烟酰胺腺嘌呤结合效果影响的方法
基本信息
申请号 | CN202110006987.8 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN112669900A | 公开(公告)日 | 2021-04-16 |
申请公布号 | CN112669900A | 申请公布日 | 2021-04-16 |
分类号 | G16B15/00;G16C20/20 | 分类 | 物理 |
发明人 | 黄易寒;李骏;汤小苏 | 申请(专利权)人 | 杭州诺莘科技有限责任公司 |
代理机构 | 杭州天勤知识产权代理有限公司 | 代理人 | 胡红娟 |
地址 | 311400 浙江省杭州市富阳区银湖街道高尔夫路83号第六幢三楼305室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种预测/验证多酚类化合物激活剂对Sirtuin与烟酰胺腺嘌呤(NAD+)结合效果影响的方法,利用一系列对复合体系的计算处理和副本交换分子动力学模拟,Sirtuin/NAD+复合物结构和Sirtuin/激活剂/NAD+复合物结构可实现全局优化并得到稳态构型。在此基础上对两种复合物体系进行结构稳定性比较、残基稳定性比较和NAD+与Sirtuin的结合能比较,预测/验证激活剂对NAD+与Sirtuin结合效果的影响。相比实验方法,本方法时间和人力成本更低,可帮助实验进行预筛选。相比传统计算方法,本方法提供了更准确的蛋白质单/双分子稳态构型,从而使稳定性和结合能的判断更准确,整体提高了激活剂预测/验证的正确率,提升效率。 |
