一种粪便微生物多样性的自动化分析方法
基本信息
| 申请号 | CN202110008338.1 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN112614540A | 公开（公告）日 | 2021-04-06 |
| 申请公布号 | CN112614540A | 申请公布日 | 2021-04-06 |
| 分类号 | G16B20/00(2019.01)I;G16B45/00(2019.01)I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 罗奇斌;申玉林;廖胜光;任毅 | 申请（专利权）人 | 天津奇云诺德生物医学有限公司 |
| 代理机构 | - | 代理人 | - |
| 地址 | 300457天津市滨海新区洞庭路122号B区101 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及微生物领域，且公开了一种粪便微生物多样性的自动化分析方法，包括原始下机数据过滤和质量控制、宿主基因组比对、微生物菌群物种注释和比对、微生物菌群代谢潜能分析、微生物多样性分析、结果统计和输出等步骤。所有步骤使用Python脚本连接实现自动化分析，减少了繁琐的人工操作，降低了人工操作带来的各种错误，方法在计算了香农多样性指数和辛普森多样性指数的同时，也分析出了样本中的不同微生物菌群的丰度和代谢通路等信息，有助于更加全面地了解粪便微生物多样性，流程在运行时不仅会输出各步骤产生的中间结果，也会对相应的数据做统计分析及整理，输出相应的图表，方便使用者的浏览，同时流程运行日志记录所有流程相关信息，方便在流程运行出错时进行筛查。 |
