基于克隆DNA混合池的全基因组测序方法专利查询专利号|摘要-满商公司网

基于克隆DNA混合池的全基因组测序方法

基本信息

申请号	CN201310288791.8	申请日	-
公开（公告）号	CN103388025B	公开（公告）日	2015-04-29
申请公布号	CN103388025B	申请公布日	2015-04-29
分类号	C12Q1/68(2006.01)I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	罗美中;潘永龙	申请（专利权）人	武汉华中农大资产经营有限公司
代理机构	武汉开元知识产权代理有限公司	代理人	华中农业大学
地址	430070 湖北省武汉市洪山区狮子山街1号
法律状态	-

摘要

本发明公开了一种基于克隆DNA混合池的全基因组测序方法。该方法首先构建BAC文库并构建BAC克隆DNA混合池，对混合池DNA进行双末端的高通量测序；解析克隆的特征序列集合与k-mer集合，利用克隆的特征序列构建克隆重叠群，利用克隆重叠群将克隆k-mer集合分割成小的k-mer集合，将混合池的NGS序列进行组装，并将组装后的序列定位到克隆重叠群上；将组装后的序列与NGS序列进行双末端比对，根据比对结果连接定位后的序列，并确定它们的方向；最后利用分子标记确定克隆重叠群的相对位置与方向，将克隆重叠群的序列连接成染色体序列。本发明利用NGS高通量测序技术与克隆DNA混合池，不仅构建出全基因组的物理图谱，同时将拼装后的序列定位到物理图谱上，实现两者的整合。