一种适用于细胞系和动物组织ATAC-seq测序技术的文库构建方法专利查询专利号|摘要-满商公司网

一种适用于细胞系和动物组织ATAC-seq测序技术的文库构建方法

基本信息

申请号	CN201910213705.4	申请日	-
公开（公告）号	CN109897885A	公开（公告）日	2019-06-18
申请公布号	CN109897885A	申请公布日	2019-06-18
分类号	C12Q1/6806（2018.01）I; C12Q1/6869（2018.01）I; C40B50/06（2006.01）I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	严琰	申请（专利权）人	嘉兴菲沙基因信息有限公司
代理机构	上海精晟知识产权代理有限公司	代理人	冯子玲
地址	314000 浙江省嘉兴市嘉善县大云镇创业路555号C2幢101室
法律状态	-

摘要

本发明涉及一种适用于细胞系和动物组织ATAC‑seq测序技术的文库构建方法，所述方法包括：1)收集细胞或动物组织，制备细胞悬液；2)加入含NP40的裂解液，裂解细胞膜，获得细胞核并纯化；3)收集细胞核进行定量和细胞核完整性检测；4)完整细胞核中加入Tn5转座酶进行转座反应并纯化；5)PCR扩增，构建二代文库并纯化；6)进行高通量测序，得到基因数据。该方法基于转座酶对DNA含量敏感的特征，直接通过DNA含量进行定量操作，适用性广，尤其适用于物种或组织稀少、保存状态较差组织进行文库构建。同时，本发明通过前期的优化使得回收到的细胞核可以用于国产vazyme公司开发的Tn5转座酶并得到了良好的实验结果，使得ATAC‑seq不再受转座酶种类的限制。