一种适用于狐尾藻的Hi-C高通量测序建库方法专利查询专利号|摘要-满商公司网

一种适用于狐尾藻的Hi-C高通量测序建库方法

基本信息

申请号	CN201910213099.6	申请日	-
公开（公告）号	CN109913529A	公开（公告）日	2019-06-21
申请公布号	CN109913529A	申请公布日	2019-06-21
分类号	C12Q1/6806（2018.01）I; C40B50/06（2006.01）I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	冯欢	申请（专利权）人	嘉兴菲沙基因信息有限公司
代理机构	上海精晟知识产权代理有限公司	代理人	冯子玲
地址	314000 浙江省嘉兴市嘉善县大云镇创业路555号C2幢101室
法律状态	-

摘要

本发明涉及适用于狐尾藻的Hi‑C高通量测序建库方法，包括：1)对狐尾藻样品进行甲醛交联获得交联物料；2)细胞裂解释放染色质；3)收集染色质并依次经SDS灭活内源酶、MboI核酸内切酶酶切打断获得酶切后物料；4)末端补平，获得末端补平后DNA，并对末端补平DNA进行分子内连接；5)解交联分子内连接物料并纯化DNA，DNA打断形成利于测序的片段；7)构建用于高通量测序的Hi‑C文库；8)特异性捕获标记了生物素的DNA片段并PCR扩增；9)文库质检。该方法针对狐尾藻细胞的特殊结构，设计合适的细胞破碎方法、甲醛交联条件、内源酶灭活条件以及合适的工具酶，解决了狐尾藻细胞壁结构对Hi‑C实验的影响，实现了狐尾藻的Hi‑C高通量测序建库，扩大了Hi‑C技术的适用范围。