一种适用于海洋藻类的Hi-C高通量测序建库方法

基本信息

申请号 CN202010274567.3 申请日 -
公开(公告)号 CN111440844A 公开(公告)日 2020-07-24
申请公布号 CN111440844A 申请公布日 2020-07-24
分类号 C12Q1/6806(2018.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 冯欢 申请(专利权)人 嘉兴菲沙基因信息有限公司
代理机构 上海精晟知识产权代理有限公司 代理人 周琼
地址 314000浙江省嘉兴市嘉善县大云镇创业路555号C2幢101室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供的适用于海洋藻类的Hi‑C高通量测序建库方法包括:1)海洋藻类样品甲醛交联;2)液氮研磨和裂解液并行裂解交联物料,释放并收集细胞染色质;3)percoll纯化细胞染色质;4)纯化后的染色质依次经SDS灭活内源酶、MboI核酸内切酶酶切打断获得酶切物料;5)酶切物料依次经粘性末端补平、分子内连接获得分子内连接物料;6)解交联分子内连接物料并纯化,打断纯化后的DNA成利于测序的片段大小从而获得DNA测序文库。该方法设计合适的细胞壁去除方法、细胞核纯化方法,使分析阶段背景噪音干扰显著减少,同时也解决了海洋藻类细胞壁厚难释放细胞质、海洋藻类样品建库效果差的技术问题,实现了海洋藻类的Hi‑C高通量测序建库,扩大了Hi‑C技术的适用范围。