适用于PacBio测序平台的原核全长初始转录本建库方法及应用专利查询专利号|摘要-满商公司网

适用于PacBio测序平台的原核全长初始转录本建库方法及应用

基本信息

申请号	CN202010275291.0	申请日	-
公开（公告）号	CN111440845A	公开（公告）日	2020-07-24
申请公布号	CN111440845A	申请公布日	2020-07-24
分类号	C12Q1/6806(2018.01)I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	方涛	申请（专利权）人	嘉兴菲沙基因信息有限公司
代理机构	上海精晟知识产权代理有限公司	代理人	周琼
地址	314000浙江省嘉兴市嘉善县大云镇创业路555号C2幢101室
法律状态	-

摘要

本发明提供一种适用于PacBio测序平台的原核全长初始转录本建库方法及应用，包括：依次在原核生物总RNA的3’末端加尾、5’末端添加生物素标记帽子，然后捕获带有生物素标记的初始转录本，最后合成初始转录本全长cDNA并构建其PacBio文库。该方法在原核转录组的3’末端加尾作为cDNA全长扩增一链合成的引物位点，实现了原核生物进行全长转录组测序，扩大了全长转录组测序技术的适用范围。同时，在初始转录本5’末端添加生物素标记的帽子，然后富集目标全长初始转录本，从而去除总RNA中的rRNA，极大的提高了数据有效率；合成全长cDNA时，在第一条链的末端添加额外核苷酸序列作为第二链引物的结合位点，避免SMARTer技术的偏好性问题，使测序更加均一。