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固有无序蛋白的药物分子设计方法和装置

基本信息

申请号 CN202111370449.3 申请日 -
公开（公告）号 CN113990401A 公开（公告）日 2022-01-28
申请公布号 CN113990401A 申请公布日 2022-01-28
分类号 G16C10/00（2019.01）I;G16C20/50（2019.01）I;G16C20/70（2019.01）I 分类 物理
发明人 孙伟杰 申请（专利权）人 北京深势科技有限公司
代理机构 北京汉智嘉成知识产权代理有限公司 代理人 姜劲;郇春艳
地址 100080北京市海淀区海淀北二街8号4层515
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种固有无序蛋白的药物分子设计方法以及装置。该方法包括如下步骤：根据固有无序蛋白的氨基酸序列构建蛋白初始三维结构，对蛋白初始三维结构进行强化动力学模拟采样至收敛以获得蛋白质的构象系综，并进行热力学性质分析，以得到热力学重要状态；根据强化动力学模拟轨迹聚类后挑选出中心构象，然后对中心构象进行经典分子动力学模拟，根据模拟轨迹构建马尔科夫态模型，迭代分子动力学模拟至马尔科夫态模型符合标准，然后对马尔科夫态模型进行分析，以得到动力学性质并且从中获得动力学重要状态；根据热力学重要状态和动力学重要状态，进行深度对接处理以及分子生成处理，以获得能够作用于固有无序蛋白的候选活性药物分子。