微生物操作分类单元确定和序列辅助分离

基本信息

申请号 CN201610333530.7 申请日 -
公开(公告)号 CN106055924A 公开(公告)日 2016-10-26
申请公布号 CN106055924A 申请公布日 2016-10-26
分类号 G06F19/20(2011.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 赵立平;王景;张梦晖 申请(专利权)人 上海臻领健康科技有限公司
代理机构 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 完美(中国)有限公司;完美(广东)日用品有限公司;扬州完美日用品有限公司
地址 528402 广东省中山市石岐区东明北路(民营科技园)
法律状态 -

摘要

摘要 基于样品中微生物的系统发生信息基因的DNA序列定义样品中的微生物操作分类单元(OTU)的方法,其通过处理原始序列读出以获得合格序列片段,根据其各自的相对丰度值对其进行排序,并且仅使用具有高丰度值的合格序列获得暂定OTU来进行。重新划归具有低丰度的合格序列,并且只有当所述合格序列与OTU序列具有至少97%的序列相似性时才将所述合格序列分别分配到合适的暂定OTU。本发明还提供了序列辅助的微生物分离方法。