微生物操作分类单元确定和序列辅助分离
基本信息
申请号 | CN201610333530.7 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN106055924A | 公开(公告)日 | 2016-10-26 |
申请公布号 | CN106055924A | 申请公布日 | 2016-10-26 |
分类号 | G06F19/20(2011.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I | 分类 | 计算;推算;计数; |
发明人 | 赵立平;王景;张梦晖 | 申请(专利权)人 | 上海臻领健康科技有限公司 |
代理机构 | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人 | 完美(中国)有限公司;完美(广东)日用品有限公司;扬州完美日用品有限公司 |
地址 | 528402 广东省中山市石岐区东明北路(民营科技园) | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 基于样品中微生物的系统发生信息基因的DNA序列定义样品中的微生物操作分类单元(OTU)的方法,其通过处理原始序列读出以获得合格序列片段,根据其各自的相对丰度值对其进行排序,并且仅使用具有高丰度值的合格序列获得暂定OTU来进行。重新划归具有低丰度的合格序列,并且只有当所述合格序列与OTU序列具有至少97%的序列相似性时才将所述合格序列分别分配到合适的暂定OTU。本发明还提供了序列辅助的微生物分离方法。 |
