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一种基于Primer3的多重PCR引物设计方法

基本信息

申请号	CN201711227679.8	申请日	-
公开（公告）号	CN107937497A	公开（公告）日	2018-04-20
申请公布号	CN107937497A	申请公布日	2018-04-20
分类号	C12Q1/686;C12N15/11	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	施玉健;周天亮文;值奇欢;兰兆吉;邝建宇	申请（专利权）人	拓普基因科技（广州）有限责任公司
代理机构	广州三环专利商标代理有限公司	代理人	拓普基因科技（广州）有限责任公司
地址	510000 广东省广州市天河区天河北路626号804房
法律状态	-

摘要

本发明提供了一种基于Primer3的多重PCR引物设计方法，其包括：S1：获取目标DNA序列的原始序列；S2：Primer3对目标序列进行PCR引物设计，并生成候选引物；S3：用PE模型或SE模型对多重PCR引物进行评估，并筛选出合格的多重PCR引物；S4：改变引物筛选参数，再次对未能设计出引物的目标DNA序列进行设计和筛选，最终获得所有目标DNA序列的多重PCR引物。本发明可识别序列相距较近的目标序列并设计兼并引物，进而减少因相距较近的目标序列的引物相互干扰而导致的非特异性扩增；系统性评估所设计引物的特异性，减少因非特异性扩增、出现引物二聚体和发夹结构等原因导致的扩增失败，为多重PCR实验设计出特异性较强的多重PCR引物。