检测肿瘤患者的突变和HRD评分指导用药的方法

基本信息

申请号 CN202110226064.3 申请日 -
公开(公告)号 CN112820351A 公开(公告)日 2021-05-18
申请公布号 CN112820351A 申请公布日 2021-05-18
分类号 G16B20/50;G16B20/20;G16B40/00;G16H20/10 分类 物理
发明人 武欣;杨文婷 申请(专利权)人 江苏医联生物科技有限公司
代理机构 北京盛凡智荣知识产权代理有限公司 代理人 马婷
地址 225000 江苏省扬州市邗江区吉安路203号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及一种检测肿瘤患者的突变和HRD评分指导用药的方法,基于BAM文件作为输入文件,对肿瘤组织样本和其对照白细胞样本进行检测,检测不同样本类型panel中的HRR通路的突变信息和基因重组修复缺陷导致的大片段的染色体异常HRD,对肿瘤组织样本进行检测的步骤包括:1)检测HRR通路的单核苷酸突变;2)检测HRR区域的杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因失衡(TAI)、大片段状态转移(LST),HRD评分=LOH、TAI和LST评分的加权后总和。本发明提供的肿瘤患者的突变和HRD评分用药指导的方法。该方法优化了传统通过全基因组检测计算HRD值评分并不利于临床实效的方法,并且提升了计算速度,检测效果好,检测结果准确,可以很好地满足实际应用的需要。