一种基于基因组组装的变异检测方法和装置

基本信息

申请号 CN201510043893.2 申请日 -
公开(公告)号 CN105989246A 公开(公告)日 2018-10-26
申请公布号 CN105989246A 申请公布日 2018-10-26
分类号 G06F19/18;G06F19/22 分类 计算;推算;计数;
发明人 黄树嘉;刘斯洋;叶伟健;饶俊华 申请(专利权)人 深圳市华大智造软件技术有限公司
代理机构 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 代理人 彭家恩;罗瑶
地址 518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于基因组组装的变异检测方法和装置,所述方法包括:获取来源于梯度测序文库的测序读段序列;对测序读段序列进行过滤;将已经过滤的读段序列拼接成平均长度达到第四预设值的长序列;将拼接得到的长序列比对到参考基因组上;和对序列比对结果进行变异检测,获取序列变异。本发明的方法有效解决了变异检测“暗区”、长序列插入和复杂结构性变异的检测难题。