比对不同全基因组测序方法的测序结果覆盖率的方法
基本信息
| 申请号 | CN202110673259.2 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113223619A | 公开（公告）日 | 2021-08-06 |
| 申请公布号 | CN113223619A | 申请公布日 | 2021-08-06 |
| 分类号 | G16B30/10;G16B50/30 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 易康;安泰然 | 申请（专利权）人 | 南京诺因生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 南京禾易知识产权代理有限公司 | 代理人 | 张松云 |
| 地址 | 211800 江苏省南京市江北新区新锦湖路3-1号中丹生态生命科学产业园一期A座1802-1807 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种比对不同全基因组测序方法的测序结果覆盖率的方法，其步骤包括：读取同一物种不同全基因组的测序结果，创建一个新的fasta文件夹，将fasta文件复制到fasta文件夹中；对fasta文件夹下的fasta文件进行建库；将fasta文件夹下fasta文件序列进行分割；使用blast工具将分割后的片段与第二步建好的数据库进行比对；通过筛选将比对到自身的序列去除；对过滤后的结果进行得分计算，排分最高的就是覆盖率最高的全基因组测序方法得到的测序结果。本发明通过对比结果，可以轻松找出哪个基因组覆盖率更高。 |
