基于特征序列设计引物的方法及系统
基本信息
| 申请号 | CN202110754999.9 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113403368A | 公开（公告）日 | 2021-09-17 |
| 申请公布号 | CN113403368A | 申请公布日 | 2021-09-17 |
| 分类号 | C12Q1/6811（2018.01）I | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 易康;安泰然 | 申请（专利权）人 | 南京诺因生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 南京禾易知识产权代理有限公司 | 代理人 | 张松云 |
| 地址 | 211800江苏省南京市江北新区新锦湖路3-1号中丹生态生命科学产业园一期A座1802-1807 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种基于特征序列设计引物的方法，其步骤包括：将阳性序列和阴性序列进行整合；将阳性序列分割成适合进行比对的片段，并记录分割的位置；使用blast对阴性序列进行建库，然后将片段化的阳性序列比对到阴性序列进行筛选，得到一致性较低的特异性序列；使用primer3对特异性序列进行引物设计，得到上游引物、下游引物和探针的序列及位置；使用blast比对软件、阴性序列数据库、NCBI的nt数据库对得到的引物和探针进行再次筛选，并取引物和探针的交集；通过目录输出比对结果。并公开了基于特征序列设计引物的系统。本发明可以一步完成从基因组到目标序列和引物片段的引物设计。 |
