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一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法

基本信息

申请号	CN201910246761.8	申请日	-
公开（公告）号	CN109979528B	公开（公告）日	2021-06-25
申请公布号	CN109979528B	申请公布日	2021-06-25
分类号	G16B20/00;G16B30/00	分类	物理
发明人	周煌凯;夏昊强;高川;张羽;陶勇;罗玥;邢燕;曾川川	申请（专利权）人	广州基迪奥生物科技有限公司
代理机构	广州三环专利商标代理有限公司	代理人	颜希文;宋静娜
地址	510000 广东省广州市广州国际生物岛螺旋三路6号第五层501、502单元
法律状态	-

摘要

本发明公开了一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法，包括如下步骤：步骤S1，原始数据进行数据质量统计与基本质控；步骤S2,对步骤S1所得的高质量的reads与参考V（D）J fragments序列进行序列比对及注释，得到Consensus序列；步骤S3，对步骤S2拼接得到的Consensus中的CDR3氨基酸序列进行Clonotype分型分型；步骤S4，对步骤S3所得样本中的Clonotype进行CDR3、V/J基因、V‑J paired特征分析；步骤S5，将不同样本中的clonotype进行合并，然后进行多样本分析。该方法分析流程完整，内容丰富，结果能够可视化展示，能够全面揭示免疫组库信息，从而使用户能够全面了解评估免疫组库状况，可以更精确地反应生物体内的免疫功能。