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一种单细胞ATAC-seq数据分析方法

基本信息

申请号	CN201910768671.5	申请日	-
公开（公告）号	CN110544509A	公开（公告）日	2021-06-11
申请公布号	CN110544509A	申请公布日	2021-06-11
分类号	G16B30/00	分类	物理
发明人	夏昊强;高川;周煌凯;张羽;陶勇;罗玥;陈飞钦;曾川川	申请（专利权）人	广州基迪奥生物科技有限公司
代理机构	广州三环专利商标代理有限公司	代理人	颜希文;宋静娜
地址	510000 广东省广州市广州国际生物岛螺旋三路6号第五层501、502单元
法律状态	-

摘要

本发明提供一种单细胞ATAC‑seq数据分析方法，包括以下步骤：步骤S1,对测序原始数据进行数据分析与质控；步骤S2,比对分析；步骤S3,插入片段分析；步骤S4,富集区域Peak分析；步骤S5,单细胞亚群分类；步骤S6,对Peak相关基因进行注释和富集；步骤S7,TF‑motif分析；步骤S8,亚群可及性差异分析；步骤S9,差异可及性位点相关基因分析，对鉴定出的差异TF‑motif所在peak区域最邻近的转录起始位点所对应的基因注释等步骤。本发明构建了一个全面、分析内容丰富的单细胞ATAC‑seq数据分析流程，分析结果揭示了大量的生物信息，方便人们深入挖掘蕴藏在单细胞水平内的生物学现象和特征，分析流程及结果以html的形式进行可视化展示，分析内容层次明了，结果展现形式多样，增加了报告的可读性。