一种基于10X单细胞转录组测序数据的分析方法
基本信息
| 申请号 | CN201910246518.6 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN109979538B | 公开（公告）日 | 2021-10-01 |
| 申请公布号 | CN109979538B | 申请公布日 | 2021-10-01 |
| 分类号 | G16B30/00（2019.01）I;G06K9/62（2006.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 夏昊强;周煌凯;高川;张羽;陶勇;罗玥;邢燕;张秋雪 | 申请（专利权）人 | 广州基迪奥生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 广州三环专利商标代理有限公司 | 代理人 | 颜希文;宋静娜 |
| 地址 | 510000广东省广州市广州国际生物岛螺旋三路6号第五层501、502单元 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种基于10X单细胞转录组测序数据的分析方法，包括步骤：S1，测序数据质控和表达量定量；S2，基于10X单细胞转录组测序数据进行单细胞亚群分类；S3，差异表达基因分析：筛选细胞亚群上调表达的基因，采用Seurat的bimod似然比统计检验，分别对不同类细胞群进行基因差异表达分析；S4，差异基因功能分析：根据S3获得的差异表达基因，进行差异表达基因GO功能分析和/或差异表达基因KEGG功能分析；S5，标记基因筛选与分析：包括标记基因筛选、标记基因表达分布、标记基因蛋白网络分析；方法还包括步骤S6，细胞轨迹分析：包括单细胞轨迹的构建、差异表达基因的分析、细胞轨迹分支分析。采用本发明的方法分析10X单细胞转录组测序数据更准确、更丰富。 |
