确定待测样本预定染色体不稳定指数的方法、系统和计算机可读介质
基本信息
申请号 | CN201910428251.2 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN111370056B | 公开(公告)日 | 2021-03-30 |
申请公布号 | CN111370056B | 申请公布日 | 2021-03-30 |
分类号 | G16B30/10(2019.01)I;G16B35/10(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 李世勇;茅矛;张锋;陈彦;钟果林;张岩;陈灏;封裕敏 | 申请(专利权)人 | 深圳思勤医疗科技有限公司 |
代理机构 | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人 | 赵天月 |
地址 | 518000广东省深圳市盐田区海山街道深盐路2028号大百汇生命健康产业园2号楼11层 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提出了确定待测样本预定染色体不稳定指数的方法。该方法包括:(1)划分窗口序列(bins);(2)与所述参考序列;(3)统计bins中每一个的匹配测序读段数目;(4)对每个bins的匹配测序读段数目进行过滤,标准化,校正处理;(5)对步骤(4)所获得的结果进行取对数处理,以便获得每个bins的测序读段数目的对数值log R ratio;(6)确定第一预选异常窗口序列;(7)确定第二预选异常窗口序列;(8)确定异常窗口序列;(9)确定所述异常窗口序列的每一个拷贝数变异发生频率;(10)确定所述待测样本针对所述预定染色体的不稳定指数。 |
