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基因组序列中潜在BGC的预测方法、装置、设备及介质

基本信息

申请号 CN202110888145.X 申请日 -
公开（公告）号 CN113764034A 公开（公告）日 2021-12-07
申请公布号 CN113764034A 申请公布日 2021-12-07
分类号 G16B15/00（2019.01）I;G16B15/30（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I 分类 物理
发明人 杨子翊;廖奔犇;张胜誉;辛志伟;梁恒宇 申请（专利权）人 河南省健康元生物医药研究院有限公司
代理机构 北京三高永信知识产权代理有限责任公司 代理人 张所明
地址 518057广东省深圳市南山区高新区科技中一路腾讯大厦35层
法律状态 -

摘要

摘要 本申请公开了一种基因组序列中潜在BGC的预测方法、装置、设备及介质，涉及人工智能领域。方法包括：对基因组序列中的各个基因进行结构域预测，得到各个基因中包含的Pfam结构域；确定各个Pfam结构域的Pfam得分，Pfam得分用于表征Pfam结构域属于BGC的概率；基于各个Pfam结构域的Pfam得分，确定基因组序列中的候选BGC；对候选BGC进行BGC类别预测，并基于类别预测结果确定候选BGC中的潜在BGC。本申请实施例采用双重串行预测机制，先根据Pfam得分实现BGC的一级过滤，然后在一级过滤结果的基础上通过类别预测实现BGC的二级过滤，有助于降低BGC预测结果的假阳率。