基于句法模式识别的药物小分子毒性预测的方法
基本信息
| 申请号 | CN202010460271.0 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN111640470A | 公开（公告）日 | 2020-09-08 |
| 申请公布号 | CN111640470A | 申请公布日 | 2020-09-08 |
| 分类号 | G16C20/30(2019.01)I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 牛张明;韦德·门佩斯-史密斯 | 申请（专利权）人 | 杭州德睿智药科技有限公司 |
| 代理机构 | 上海智晟知识产权代理事务所（特殊普通合伙） | 代理人 | 牛张明;韦德·门佩斯-史密斯 |
| 地址 | 浙江省杭州市钱塘新区新加坡科技园15幢11楼 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种基于句法模式识别的药物小分子毒性预测的方法，包括：获取数据集；对所述数据集进行预处理，包括将所述数据集中的所有化合物分子用SMILES表示，对所有分子的SMILES表达式做标准化处理，统一分子SMILES表达式中的原子、键、连接关系的编码方式和顺序，然后进行去重复化处理；对预处理的数据集进行编码，其中通过独热编码对SMILES序列的单个元素、单个数字、单个符号以及整个方括号看作一个基元片段。每个基元片段本身是具有化学意义和指向性的，任何基元片段的组合也是符合化学规则，所述所有分子的SMILES表达式转换为向量组合；构建句法模式识别模型；将向量组合输入所述句法模式识别模型，预估分子是否含有特定靶标的毒性；以及对所述句法模式识别模型进行评估。 |
