一种基于二代测序的人类白细胞抗原分型系统和方法

基本信息

申请号 CN202110797301.1 申请日 -
公开(公告)号 CN113373208A 公开(公告)日 2021-09-10
申请公布号 CN113373208A 申请公布日 2021-09-10
分类号 C12Q1/6869(2018.01)I;G16B20/30(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 李傲;蔡丽婷;王佳伟 申请(专利权)人 上海序祯达生物科技有限公司
代理机构 上海市汇业律师事务所 代理人 王函;余艳
地址 200131上海市浦东新区中国(上海)自由贸易试验区奥纳路55号1幢607室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于二代测序的人类白细胞抗原分型系统和方法。该系统,包括:二代测序模块,用于DNA样本的二代测序;高精度HLA比对模块,用于通过高精度高稳定性的比对方法将二代测序数据比对至HLA参考序列上;HLA分型模块,用于利用距离矩阵方法对比对至HLA参考序列上的数据进行HLA分型;高精度HLA比对模块分别与二代测序模块和HLA分型模块信号连接。本发明解决了HLA分型准确度和稳定性低的问题。通过优选高精度高稳定性的方法,本发明能够在保持准确度的前提下,大幅提升HLA分型的稳定性,从而提升下游免疫治疗疗法的有效性与安全性。