一种基于二代测序的人类白细胞抗原分型系统和方法
基本信息
申请号 | CN202110797301.1 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN113373208A | 公开(公告)日 | 2021-09-10 |
申请公布号 | CN113373208A | 申请公布日 | 2021-09-10 |
分类号 | C12Q1/6869(2018.01)I;G16B20/30(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 李傲;蔡丽婷;王佳伟 | 申请(专利权)人 | 上海序祯达生物科技有限公司 |
代理机构 | 上海市汇业律师事务所 | 代理人 | 王函;余艳 |
地址 | 200131上海市浦东新区中国(上海)自由贸易试验区奥纳路55号1幢607室 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种基于二代测序的人类白细胞抗原分型系统和方法。该系统,包括:二代测序模块,用于DNA样本的二代测序;高精度HLA比对模块,用于通过高精度高稳定性的比对方法将二代测序数据比对至HLA参考序列上;HLA分型模块,用于利用距离矩阵方法对比对至HLA参考序列上的数据进行HLA分型;高精度HLA比对模块分别与二代测序模块和HLA分型模块信号连接。本发明解决了HLA分型准确度和稳定性低的问题。通过优选高精度高稳定性的方法,本发明能够在保持准确度的前提下,大幅提升HLA分型的稳定性,从而提升下游免疫治疗疗法的有效性与安全性。 |
