一种细菌菌株的分析方法、分析装置和存储介质专利查询专利号|摘要-满商公司网

一种细菌菌株的分析方法、分析装置和存储介质

基本信息

申请号	CN202011146154.3	申请日	-
公开（公告）号	CN112233726A	公开（公告）日	2021-01-15
申请公布号	CN112233726A	申请公布日	2021-01-15
分类号	G16B30/10;G16B40/00	分类	物理
发明人	胡函;谭验	申请（专利权）人	深圳未知君生物科技有限公司
代理机构	北京金信知识产权代理有限公司	代理人	深圳未知君生物科技有限公司
地址	518000 广东省深圳市南山区西丽街道清华信息港科研楼10层1007室
法律状态	-

摘要

本公开涉及一种细菌菌株的分析方法、分析装置和存储介质。该方法包括：获取目标菌种的泛基因组数据，包括其多类菌种的参考基因序列；获取多个样品(包括多个菌种)的测序数据；将每个样品的测序数据与泛基因组数据进行比对，以得到相对于各参考基因的比对计数；将相似基因的比对计数合并为基因家族的比对计数以确定第一矩阵，第一矩阵的各个元素表征各个基因家族在各样品中的比对计数相关信息；将第一矩阵分解为第二和第三矩阵，第二矩阵的各个元素表征各个基因家族在各类菌株中的存在相关信息，第三矩阵的各个元素表征各类菌株在各样品中的相对丰度相关信息。可准确得到各样品中多个菌种的各类菌株的组成比例情况及每类菌株的基因家族包含情况。