预测小分子CYP代谢酶的代谢位点的方法及系统

基本信息

申请号 CN202110420115.6 申请日 -
公开(公告)号 CN113270152A 公开(公告)日 2021-08-17
申请公布号 CN113270152A 申请公布日 2021-08-17
分类号 G16C20/50(2019.01)I;G16C20/30(2019.01)I;G06N3/04(2006.01)I;G06N3/08(2006.01)I 分类 物理
发明人 李远鹏;陈萍;赖力鹏;温书豪;马健 申请(专利权)人 北京晶泰科技有限公司
代理机构 深圳市科吉华烽知识产权事务所(普通合伙) 代理人 胡玉
地址 100083北京市海淀区中关村东路8号东升大厦AB座七层706单元
法律状态 -

摘要

摘要 一种预测小分子CYP代谢酶的代谢位点的方法及系统,包括:收集与代谢位点相关的分子结构数据,基于不同代谢酶亚型将收集的数据整理成为不同亚型的数据集;将二维分子结构转化为三维分子结构;将分子三维结构中的原子类型的矢量化;将分子三维结构中距离的矢量化;将原子类型的矢量作为图卷积神经网络中顶点信息矢量化矩阵,将距离的矢量作为图卷积神经网络中边信息矢量化矩阵,根据图卷积神经网络模型更新顶点信息,计算原子为代谢位点的概率;在不同CYP代谢酶亚型上根据为代谢位点的概率预测代谢位点;上述方法及系统,对分子与不同亚型的CYP代谢发生化学反应的代谢位点预测,该预测结果可以帮助药物化学家设计或者优化分子结构。