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一种基于TopoMA定量构效关系模型的药物设计方法

基本信息

申请号	CN202011085973.1	申请日	-
公开（公告）号	CN112102900A	公开（公告）日	2020-12-18
申请公布号	CN112102900A	申请公布日	2020-12-18
分类号	G16C20/50;G16C20/70;G16C20/90;G16C20/80	分类	物理
发明人	马松龄;马文志;赖力鹏;温书豪;马健	申请（专利权）人	北京晶泰科技有限公司
代理机构	深圳市科吉华烽知识产权事务所（普通合伙）	代理人	北京晶派科技有限公司
地址	100083 北京市海淀区中关村东路8号东升大厦C座三层333单元
法律状态	-

摘要

本发明提供一种基于TopoMA定量构效关系模型的药物设计方法，包括：步骤（1）:在一个化合物上指定若干非环单键，通过所述非环单键将化合物分割出多个侧链；步骤（2）：对于步骤（1）中分割出的每条侧链，TopoMA会执行侧链对齐至定位基、手性检查与调整、单键二面角调整以及非平面环检查与调整；步骤（3）：对侧链进行CoMFA分析，通过SP³碳原子探针计算侧链在三维空间中的立体场描述符与静电场描述符，将每个分子三维格点的描述符平铺为一维向量，由多个分子的描述符组成矩阵，每个分子产生一个特征向量；步骤（4）：建立分子描述符与生物活性数据之间关系的模型。相对于Topomer CoMFA方法采用PLS建模的单一建模方法而言，本发明有更大可能得到更好的模型。