一种蛋白骨架设计方法及其应用
基本信息
| 申请号 | CN202011382858.0 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN112382336A | 公开（公告）日 | 2021-02-19 |
| 申请公布号 | CN112382336A | 申请公布日 | 2021-02-19 |
| 分类号 | G16B5/00(2019.01)I; | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 王天元;吴炜坤;赖力鹏;温书豪;马健 | 申请（专利权）人 | 北京晶泰科技有限公司 |
| 代理机构 | 深圳市科吉华烽知识产权事务所（普通合伙） | 代理人 | 胡吉科 |
| 地址 | 100083北京市海淀区中关村东路8号东升大厦C座三层333单元 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供一种小蛋白骨架的设计方法及其应用，包括以下步骤，S1：创建专用的结构片段数据库；S2:生成小蛋白骨架数据库；S3:对小蛋白骨架进行氨基酸序列优化和设计；S4:采用与稳定性相关的指标对结构进行评价和过滤，不满足标准的结构将被移除过滤，最终形成计算预测上能够稳定折叠的小蛋白。本方法与现有方法最大的不同在于，文献报道设计的拓扑结构为HLHLHLHLH，而本发明设计的是更小的拓扑结构为HLHLH的蛋白，并且本发明根据HLHLH 拓扑结构的专门定义了更加严格的过滤标准，改进了SEWING的采样方法，因此设计出来的蛋白稳定性和序列可设计性应当更高，并且计算过程中优质骨架生成的效率更高。 |
