一种FFPE组织样本的超低频建库方法
基本信息
| 申请号 | CN201711355441.3 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN107916288A | 公开（公告）日 | 2018-04-17 |
| 申请公布号 | CN107916288A | 申请公布日 | 2018-04-17 |
| 分类号 | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 | 分类 | 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程; |
| 发明人 | 张仕坚;严建龙 | 申请（专利权）人 | 普瑞基准科技（北京）有限公司 |
| 代理机构 | 北京华识知识产权代理有限公司 | 代理人 | 普瑞基准科技（北京）有限公司 |
| 地址 | 100000 北京市海淀区清河三街72号23号楼2层2166室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种FFPE组织样本的超低频建库方法，步骤包括：FFPE样本的DNA提取；DNA打断；去磷酸化与DNA变性；生物素UID单链接头的添加；链霉素磁珠捕获与洗脱；双链第二接头的添加与文库洗脱：通过T4DNA连接酶，在上述靶DNA分子的另一端加上第二个接头，并洗去过剩与残留的接头；LM‑PCR扩增，引入barcode；磁珠纯化PCR扩增产物。本发明针对某些严重降解的FFPE DNA微量样本实现建库捕获测序，在建库开始前通过引入UID标签接头，从而为后续排除建库、捕获以及上机测序过程中引入的技术突变提供前提条件。 |
