一种基于高通量测序的线粒体序列拼接及拷贝数测定的方法

基本信息

申请号 CN201710265077.5 申请日 -
公开(公告)号 CN108733974B 公开(公告)日 2021-12-17
申请公布号 CN108733974B 申请公布日 2021-12-17
分类号 G16B30/10 分类 计算;推算;计数;
发明人 王尧峰;薛金会;郭海燕;王伟伟;程恩泽 申请(专利权)人 沈阳中科赛尔生物科技有限公司
代理机构 沈阳科苑专利商标代理有限公司 代理人 李颖;周秀梅
地址 110169 辽宁省沈阳市浑南区创新路153-6号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明属于基因组学技术领域,具体涉及一种利用高通量测序(下一代测序、第二代测序、深度测序)技术直接测定真核生物线粒体序列及拷贝数的方法。本发明包括对总DNA进行高通量测序;测序数据的质控;基于类似宏基因组的序列拼接;线粒体含量的计算。本方法实现了在不需进行线粒体富集操作的前提下使用较少测序数据进行线粒体的组装,具有实验简单,样本质量要求低,拼接完整度好,可以测量线粒体相对含量的特点。可以在一定程度上满足科研及应用需求。