一种分析靶向测序Panel估算肿瘤突变负荷可行性的方法和装置
基本信息
申请号 | CN202011635223.7 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN112786103A | 公开(公告)日 | 2021-05-11 |
申请公布号 | CN112786103A | 申请公布日 | 2021-05-11 |
分类号 | G16B15/30;G16B30/00;G16H70/40 | 分类 | 物理 |
发明人 | 张仕坚;季序我 | 申请(专利权)人 | 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 |
代理机构 | 北京品源专利代理有限公司 | 代理人 | 巩克栋 |
地址 | 215011 江苏省苏州市高新区旺米街66号 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供了一种分析靶向测序Panel估算肿瘤突变负荷(TMB)可行性的方法和装置,根据全外显子组(WES)和Panel的基因长度及突变数量,计算WES和PanelTMB;按相同的分组规则,分别根据WES及PanelTMB,将样本分为全外显子组及Panel中的不同高低等级组,并据此计算严重错误分组百分比,分析靶向测序Panel估算TMB的可行性。本发明采用多种方法定量评估WESTMB和Panel估算的TMB的一致性,包括相关性系数和严重错误分组百分比,两者的评估结论一致。本发明的特色之处在于:在按照癌种分类的基础上,进一步按性别或年龄分类,并分析性别或年龄因素对TMB一致性的影响,将临床决策进一步细化,提高决策准确率;对现有Panel进行优化及为构建新Panel提供了方法。 |
