一种采用ddPCR鉴定PML‑RARα融合基因中Brc2亚型的方法

基本信息

申请号 CN201710505922.1 申请日 -
公开(公告)号 CN107529556A 公开(公告)日 2018-01-02
申请公布号 CN107529556A 申请公布日 2018-01-02
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 陆军;金安娜 申请(专利权)人 云健康基因科技(上海)有限公司
代理机构 - 代理人 -
地址 201401 上海市奉贤区望园路1698弄8幢
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种采用ddPCR鉴定PML‑RARα融合基因中Brc2亚型的方法,该方法包括提取血液中的RNA并进行QC评估,还包括RNA反转录cDNA并进行QC评估。本发明ddPCR检测PML‑RARA融合bcr2亚型可达0.01%的丰度,远超RT‑PCR的0.1%,重复性好,无假阳性;在低AF(0.01%)的情况下,建议样本投入量增加,或重复多个平行操作。由于该技术的高灵敏度,因此可应用于疾病的早期确诊、动态监测和防治复发。本发明针对常见的Brc2型,设计检测fusion探针,引物针对fusion两侧序列进行扩增;将RARA基因作为内参,设计Ref探针,引物仅扩增RARA基因。