一种通过扩增16S rDNA保守区序列检测细菌的方法

基本信息

申请号 CN201811631519.4 申请日 -
公开(公告)号 CN109554441A 公开(公告)日 2019-04-02
申请公布号 CN109554441A 申请公布日 2019-04-02
分类号 C12Q1/6851(2018.01)I; C12Q1/689(2018.01)I; C12Q1/14(2006.01)I; C12Q1/10(2006.01)I; C12Q1/04(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 赵简; 雷颖; 白志慧; 张守梅 申请(专利权)人 上海思济细胞技术中心(有限合伙)
代理机构 上海骁象知识产权代理有限公司 代理人 同济大学; 上海思济细胞技术中心(有限合伙)
地址 200092 上海市杨浦区四平路1239号
法律状态 -

摘要

摘要 一种通过扩增16S rDNA保守区序列检测细菌的方法,利用RT‑PCR方法扩增细菌16S rDNA的保守区序列,标准品为含有16S rDNA部分保守区序列的pUC57质粒,在PCR反应体系中含有200nM正向引物,200nM反向引物,再加入适量模板,通过含有16S rDNA部分保守区序列的pUC57质粒建立标准曲线,再根据待检测样本的CT值来计算细菌的浓度。本发明方法在阈值设定在10000时,待检测样本CT值<35,且Tm在83.6℃‑85℃之间为细菌污染,能检测的大肠杆菌浓度极限在3‑33cfu/μl之间,能检测的DNA拷贝数极限在1.6×102copies左右,2h即可得出结果。