一种获得基因单体型序列的方法及其应用

基本信息

申请号 CN201810992800.4 申请日 -
公开(公告)号 CN108985009B 公开(公告)日 2022-06-07
申请公布号 CN108985009B 申请公布日 2022-06-07
分类号 G16B30/10(2019.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 郎娜;梁帆;杨旗;查建军;高玉梅;贺希文;汪德鹏 申请(专利权)人 北京希望组生物科技有限公司
代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司 代理人 -
地址 102206北京市昌平区科技园区生命园路29号1幢A301-303室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明的一方面提供了一种获得基因单体型序列的方法,所述方法包括步骤:1)生成矩阵;2)分相,包括步骤:2.1)按窗口编码归一化矩阵;2.2)筛选杂合分相窗口;3)相位的确定;4)精细分相;5)矫正;6)基因分型。本发明的另一方面提供上述方法在基因分型中的应用。本发明的方法适合多态性高、重复序列复杂的序列,使用滑窗矫正分相,去除了比对多样性和错误率的影响,并使用循环迭代分相,达到一致性最高的分相结果。