同源序列和同源序列中串联重复序列的检测方法、计算机可读介质和应用

基本信息

申请号 CN201910599481.5 申请日 -
公开(公告)号 CN111508561A 公开(公告)日 2020-08-07
申请公布号 CN111508561A 申请公布日 2020-08-07
分类号 G16B30/10 分类 -
发明人 靳红帅;吴昕;汪德鹏 申请(专利权)人 北京希望组生物科技有限公司
代理机构 北京超成律师事务所 代理人 高荣英
地址 102200 北京市昌平区科技园区生命园路29号1幢A301-3室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种同源序列和同源序列中串联重复序列的检测方法、计算机可读介质和应用,涉及基因测序技术领域。同源序列的检测方法包括提取出目标同源序列间的差异位点作为打分位点给测序reads打分,并通过合理的计算分值的方法,将测序reads匹配至与其同源性最高的同源序列中,提高了数据分析的准确性。同源序列中串联重复序列的检测方法采用将测序reads和重复单元标准序列比对以获得该条reads的重复序列的重复数,通过统计与目标同源序列reads的重复序列的重复数的支持reads数获取同源序列中重复序列的重复数,缓解了现有技术中缺乏一种兼具效率和准确度的检测重复序列的检测方法的问题。