一种基于Bionano平台检测长串联重复序列的方法
基本信息
| 申请号 | CN201810191588.1 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN108460248B | 公开（公告）日 | 2022-02-22 |
| 申请公布号 | CN108460248B | 申请公布日 | 2022-02-22 |
| 分类号 | G16B40/00（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I | 分类 | 计算；推算；计数; |
| 发明人 | 李丕栋;周家蓬;王凯;孙贝贝;汪德鹏 | 申请（专利权）人 | 北京希望组生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京纪凯知识产权代理有限公司 | 代理人 | 陆惠中;王永伟 |
| 地址 | 102206北京市昌平区科技园区生命园路29号1幢A301-3室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供一种基于Bionano平台检测长串联重复序列的方法。本发明的方法通过构建朴素贝叶斯分类器机器学习模型，对Bionano数据进行过滤，去除插入、缺失位点的假阳性错误，并基于比对算法实现长串联重复单元计数，减少运行时间、计算资源的消耗。所述方法还可以结合聚类分析算法和每条reads上的重复单元数目，确定样本基因型为纯合、杂合或者嵌合体。 |
