一种基于三代测序平台的HLA基因分型方法

基本信息

申请号 CN201810191663.4 申请日 -
公开(公告)号 CN108460246B 公开(公告)日 2022-02-22
申请公布号 CN108460246B 申请公布日 2022-02-22
分类号 G16B30/10(2019.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 郎娜;金杰;龚淳;杨帆;周家蓬;汪德鹏 申请(专利权)人 北京希望组生物科技有限公司
代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司 代理人 陆惠中;王永伟
地址 102206北京市昌平区科技园区生命园路29号1幢A301-3室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于三代测序平台的HLA基因分型方法,包括以下步骤:(1)对需要分型的HLA基因进行PCR扩增;(2)PCR所得产物检测合格后,进行三代测序,获得原始数据;(3)将原始数据与参考基因序列进行长序列比对;(4)比对后对测序错误进行矫正;(5)分相得到单体型序列;(6)分型判断。相比于现有的HLA基因分型方法,本发明的HLA分型方法对计算资源要求少、分型快、分辨率高,对临床移植组织配型、群体遗传学、人类学和进化学等应用和基础研究工作具有重要价值。